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O Hino do Colégio, cuja letra e música é de autoria do Maestro Arthur Muller, pai de um aluno, data de 1960. Em 1984, foi proposta a ampliação da letra e, após concurso, a família Lopes Castro sagrou-se vencedora, ampliando-a em três estrofes. Os arranjos desta última versão são do Coral das Edições Paulinas e do Maestro Eduardo Assad.

I
Nosso colégio é exemplar
continuação do nosso lar.
Temos um guia em cada Irmã.
Luz que ilumina o amanhã.

Amo a Deus, e a minha Terra
ao estudo tenho penhor...
Nossa escola traz o nome de Pio XII
como exemplo de fé e amor.

Nosso lema é estudar com disciplina
é assim que a escola nos ensina.
O Colégio Pio XII é exemplar
continuação do nosso lar.

II
Com grande amor e muito zelo
Aprendemos a lição;
Sendo Pio XII nosso modelo
e São Francisco a proteção.

Convivemos sempre contentes
E cantamos o nosso hino
Salve, salve nosso corpo docente
Na beleza do nosso ensino

Nossa meta é da pátria o futuro
que queremos no presente preparar
Estudando com afinco e apuro
Em nossa Escola exemplar.